Macでソフトをアンインストールするときに、ソフトだけでなく初期設定も削除してくれる「AppTrap」というソフトがありました。Mac OS X 10.6 Snow Leopardにも対応しているようです。
With AppTrap, when you move an application to the trash, you’re automatically asked if you want to move the associated preference files as well. Now that’s uninstallation, the Mac way.